Дальнейшая его судьба неизвестна. Вместе с ним были репрессированы и другие жители села.
Реабилитирован 12 октября 1989 года. В память священника и других жителей села, острадавших от политических репрессий, 28 октября 2011 г. около алтарной части храма был водружен поклонный крест.
Старожилы рассказывают, что в 1929 г. в селе был страшный пожар. Сгорело 73 дома, уцелела лишь часть улицы у церкви и сама церковь: «Стена огня дошла до храма и остановилась».
По архивным данным церковь закрыта и разграблена где-то в 1934 г. Этот же год называют многие старожилы.
Последним священником храма был Стрежнев Алексей Петрович. Он был арестован 23 августа 1931 года и приговорен к 5 годам ссылки.
На обоих куполах (колоколенном и центральной части) видны дырки от выстрелов по крестам дробью.
Карагаевская – одна из немногих церквей Уфимской епархии, коя не была обезглавлена, внешний облик храма сохранился полностью, сброшены только кресты, один из них чудом сохранился и стоит на могилке внука последнего священника на Карагаевском кладбище.
Ныне прихожанами возрождаемой церкви являются жители из соседних деревень, в первую очередь из ближайшей деревни Некрасовки, лежащей по другому берегу Мендима.
К 2020-м годам от двухсветного Карагаевского храма осталась лишь прямо стоящая колокольня и алтарная стена, всё остальное постепенно сложилось и рухнуло.
С 1960-х по 90-е гг. почти все русские жители массово выехали из деревни, продавая за бесценок дома и усадьбы, село почти полностью заселили башкиры из окрестных деревень, в начале XXI века из 102 дворов православных осталось 2.
По воспоминаниям очевидцев, церковь использовали под зерносклад, гостиницу, магазин, клуб, столовую.
С середины 1950-х гг. – под сельский клуб, для которого внутрихрамовое пространство за счёт второго света было разделено на два этажа, наверху поместили правление. В 1970-80-е гг. здесь был хозяйственный магазин.